La FAGELCO s'est assigné pour objectif principal l'encadrement des associations et exploitations, non seulement des agriculteurs, mais aussi des éleveurs dans plusieurs provinces de la République démocratique du Congo, notamment : Kinshasa, Kongo Central, Mai-Ndombe, Kwilu, Kwango, Mongala, Équateur, Tshuapa, Sud-Ubangi et Nord-Ubangi.

Elle entend aussi étudier et élaborer les projets des membres susceptibles de bénéficier d’un financement, faciliter l’évacuation des produits vers les centres de consommation, promouvoir le développement agricole par la création de coopératives agricoles et faciliter aux opérateurs l’accès aux produits phyto et zoosanitaires. La FAGELCO mène également des actions de vulgarisation des techniques agro-pastorales modernes et aide ses membres à obtenir des outils, des intrants agricoles ainsi que d’autres produits vétérinaires.

Elle organise aussi des séminaires de formation dans le but d’encadrer, de former et d’informer les membres sur les nouvelles technologies en matière d’élevage, tout en rendant la population actrice principale du développement rural afin de lui permettre d’assumer elle-même, de manière responsable, son propre destin. Elle contribue en outre à la réhabilitation des routes de desserte agricole, à la création d’un centre de distribution et de vente à bon prix des produits de ses membres, à la promotion de l’autosuffisance alimentaire et à la lutte contre la hausse des prix en ravitaillant la ville de Kinshasa, la capitale, ainsi que les autres grandes villes.